NCBI BLAST+ 설치 및 실행하기

Blast 는 Basic local alignment Search Tool의 약자로서 아미노산 서열이나 뉴클레오티드 서열을 기반으로 query sequence가 database sequence 어디에 위치해있는지 찾아내는 프로그램이다.

1990년 논문이 나왔으며 2017년 현재 65000회 이상 인용되었다.

Stephen F. Altschul, Warren Gish, Webb Miller, Eugene W. Myers, David J. Lipman, Basic local alignment search tool, Journal of Molecular Biology, Volume 215, Issue 3, 1990, Pages 403-410, ISSN 0022-2836, http://dx.doi.org/10.1016/S0022-2836(05)80360-2.

(http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022283605803602)

최신버전 다운로드는 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 에서 할 수 있다. 

OS버전에 맞게 받으면 된다.

별도의 설치가 필요하지는 않으며

tar -zxf ncbi-blast-*.tar.gz

압축을 푼 뒤 bin folder를 PATH에 잡아주기만 하면 끝.

blast는 단독으로 쓰기보단 다른 프로그램과 연동해서 쓰는 경우가 많은 것 같다.