HMMER 설치 및 실행하기

HMMER: biosequence analysis using profile hidden Markov model

sequence homologs를 사용하는 sequence searching 프로그램이며 profile하는데 hidden Markov model 알고리즘을 을 사용한다.

공식 홈페이지 http://hmmer.org/  에 가서 Download 탭으로 이동 후 OS 버전에 맞는 파일을 다운 받는다.

tar -zxf hmmer-3.1b2.tar.gz

cd hmmer-3.1b2

./configure --prefix=/PATH/TO/INSTALL

make && make install

마지막으로 prefix에 설정해둔 디렉토리로 가서 bin 폴더를 PATH에 추가하면 끝.