Molecular disease

Molecular disease

겸형 적혈구 빈혈증은 1977년 β-globin 유전자의 손상에 의해 일어나는 최초의 분자 질환으로 기록되었으며 이 후로 유전자의 손상이 질병과 연관되어 있다는 것이 알려졌다. 이후 NGS의 발달로 sequencing 가격이 저렴해지면서 single nucleotide level의 mutation까지 측정할 수 있게 되었고 특정한 유전자 염기의 변이가 질병과 관련 있다는 연구가 진행되기 시작했다.

하지만 질병이 생길 수 있는 요인을 매우 다양하기 때문에 특정 변이와 질병관의 관계성을 특정짓기가 쉽지 않아 미국의학유전학회(American Medical College of Medical Genetics and Genomics, ACMG)는 이를 다섯가지 단계로 분류하기로 하였다.

Pathogenic

- 이미 신뢰할만한 데이터가 해당 변이와 질병간의 관계를 뒷받침 하고 있는 연구결과가 존재할 때 

Likely pathogenic

- 이전에는 보고되지 않았지만 질병과 연관되어 있는 유전자의 단백질 구조에 영향을 주는 변이가 발견되었을 때

Uncertain significance

- 이전에는 보고되지 않았고 다른 포유동물에서 해당 아미노산이 보존되어 있지만 변이가 발견되었을 때 

Likely benign

- 해당 변이가 이 전에 발견되었으며 in silico 실험 결과 영향력이 크지 않을 때

Benign

- 잦은 빈도로 변이가 발견되며 in silico 분석 결과 큰 영향이 없으며 또한 해당 변이를 친족이 가지고 있으나 같은 질병에 대해서 아무런 징후가 없을 때

위의 표기 방법을 따르는 것은 강제적인 것은 아니나 일반적으로 널리 쓰이는 방법이니 알아두는 것이 좋다.

source -

https://en.wikipedia.org/wiki/Variant_of_uncertain_significance#Classification

Sue Richards, PhD et al., Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology, Genetics in Medicine, 2015