Centos 6에서 R 설치를 위한 라이브러리 설치
Root권한이 있다면 yum이나 apt-get으로 설치하면서 진행할 수 있겠지만 local로 설치하려고 하니 local library에 따로 설치해야 하는 것들이 많아서 정리해 보고자 한다.
먼저 local library 설치 폴더를 만든다. 간단하게 만들어도 무방하다.
zlib
제일 처음 문제가 생긴 부분은 zlib 버전이 1.2.5 미만이라는 것. zlib를 다운받는다. 이때 1.2.10 이상 버전을 받으면 lexiographically 1.2.10이 더 낮다고 판단하는 문제가 있기 때문에 무난하게 1.2.9로 받도록 하자. (lexiographically는 숫자를 문자로 인식해서 5와 15를 비교할 때 5 > 1 로 비교해서 5가 15보다 더 높다고 비교하는 방식이다.)
참조 (https://stackoverflow.com/questions/42076936/zlib-bz2-library-and-headers-are-requried-for-compiling-r)
wget https://osdn.net/frs/g_redir.php?m=kent&f=libpng%2Fzlib%2F1.2.9%2Fzlib-1.2.9.tar.gz
tar -zxf zlib-1.2.9.tar.gz
cd zlib-1.2.9
./configure --prefix=~/library
make && make install
일반적인 설치 방법대로 하면 zlib가 설치된다. 설치가 끝나면 ~/library 폴더 안에 lib와 include폴더가 생성되는데 여기에 나머지 라이브러리들도 다 넣고 이 라이브러리 경로를 잡아서 R을 설치 할 것이다.
bzip
bzip은 설치방법이 약간 다르다. configure가 없다. 바로 make를 하는데 prefix가 대문자임에 주의하면서 진행하면 된다.
wget http://www.bzip.org/1.0.6/bzip2-1.0.6.tar.gz
tar -zxf bzip2-1.0.6.tar.gz
cd bzip2-1.0.6
make --PREFIX=~/library
liblzma
lzma는 lzma를 직접 설치하는게 아니라 XZ를 설치하면 자동으로 해결된다. https://tukaani.org/xz/ 에서 받을 수 있다.
wget https://tukaani.org/xz/xz-5.2.4.tar.gz
tar -zxf xz-5.2.4.tar.gz
cd xz-5.2.4
./configure --prefix=~/library
make && make install
pcre
pcre는 추가로 설정해줘야하는 부분이 있다. 우선 파일은 https://ftp.pcre.org/pub/pcre/에서 받으면 되는데 pcre2를 받지 말고 pcre 8.42정도를 받자.
wget https://ftp.pcre.org/pub/pcre/pcre-8.42.tar.gz
tar -zxf pcre-8.42.tar.gz
cd pcre-8.42
./configure --prefix=~/library --enable-utf8
make && make install
cd ~/library/include
mkdir pcre
ln -s pcre* include/.
make 이후에 ~/library/include에 생성된 pcre.h 헤더 파일이 있는데 이 파일을 include/pcre 폴더 안에 링크로 넣어주는 작업까지 해야 완료가 된다. 왜인지는 모르겠지만 R 설치시 헤더파일을 pcre폴더 안에서 찾기 때문이다.
curl
마지막으로 curl은 일반적인 설치 방식을 따라가면 된다. https://curl.haxx.se/download.html
wget https://curl.haxx.se/download/curl-7.61.0.tar.gz
tar -zxf curl-7.61.0.tar.gz
cd curl-7.6.10
./configure --prefix=~/library
make && make install
모든 dependency가 설치되었으면 R의 configure를 해보도록 하자.
./configure --prefix=/PATH/TO/INSTALL/R --enable-R-shlib LDFLAGS="-L~/library/lib/" CPPFLAGS="-I~/library/include/"
make && make install
중간에 warning이 뜨긴 했지만 일단 무시하고 진행했으며 R일 실행되는 것 까지 확인하였다.
Reference -
https://unix.stackexchange.com/questions/343452/how-to-install-r-3-3-1-in-my-own-directory
