centos 6에서 R 설치를 위한 라이브러리 설치

Centos 6에서 R 설치를 위한 라이브러리 설치

Root권한이 있다면 yum이나 apt-get으로 설치하면서 진행할 수 있겠지만 local로 설치하려고 하니 local library에 따로 설치해야 하는 것들이 많아서 정리해 보고자 한다.

먼저 local library 설치 폴더를 만든다. 간단하게 만들어도 무방하다.

mkdir ~/library 

zlib

제일 처음 문제가 생긴 부분은 zlib 버전이 1.2.5 미만이라는 것. zlib를 다운받는다. 이때 1.2.10 이상 버전을 받으면 lexiographically 1.2.10이 더 낮다고 판단하는 문제가 있기 때문에 무난하게 1.2.9로 받도록 하자. (lexiographically는 숫자를 문자로 인식해서 5와 15를 비교할 때 5 > 1 로 비교해서 5가 15보다 더 높다고 비교하는 방식이다.)

참조 (https://stackoverflow.com/questions/42076936/zlib-bz2-library-and-headers-are-requried-for-compiling-r)

wget https://osdn.net/frs/g_redir.php?m=kent&f=libpng%2Fzlib%2F1.2.9%2Fzlib-1.2.9.tar.gz

tar -zxf zlib-1.2.9.tar.gz

cd zlib-1.2.9

./configure --prefix=~/library

make && make install

일반적인 설치 방법대로 하면 zlib가 설치된다. 설치가 끝나면 ~/library 폴더 안에 lib와 include폴더가 생성되는데 여기에 나머지 라이브러리들도 다 넣고 이 라이브러리 경로를 잡아서 R을 설치 할 것이다.

bzip

bzip은 설치방법이 약간 다르다. configure가 없다. 바로 make를 하는데 prefix가 대문자임에 주의하면서 진행하면 된다.

wget http://www.bzip.org/1.0.6/bzip2-1.0.6.tar.gz

tar -zxf bzip2-1.0.6.tar.gz

cd bzip2-1.0.6

make --PREFIX=~/library

liblzma

lzma는 lzma를 직접 설치하는게 아니라 XZ를 설치하면 자동으로 해결된다. https://tukaani.org/xz/ 에서 받을 수 있다.

wget https://tukaani.org/xz/xz-5.2.4.tar.gz

tar -zxf xz-5.2.4.tar.gz

cd xz-5.2.4

./configure --prefix=~/library

make && make install

pcre

pcre는 추가로 설정해줘야하는 부분이 있다. 우선 파일은 https://ftp.pcre.org/pub/pcre/에서 받으면 되는데 pcre2를 받지 말고 pcre 8.42정도를 받자.

wget https://ftp.pcre.org/pub/pcre/pcre-8.42.tar.gz

tar -zxf pcre-8.42.tar.gz

cd pcre-8.42

./configure --prefix=~/library --enable-utf8

make && make install

cd ~/library/include

mkdir pcre

ln -s pcre* include/.

make 이후에 ~/library/include에 생성된 pcre.h 헤더 파일이 있는데 이 파일을 include/pcre 폴더 안에 링크로 넣어주는 작업까지 해야 완료가 된다. 왜인지는 모르겠지만 R 설치시 헤더파일을 pcre폴더 안에서 찾기 때문이다.

curl

마지막으로 curl은 일반적인 설치 방식을 따라가면 된다. https://curl.haxx.se/download.html

wget https://curl.haxx.se/download/curl-7.61.0.tar.gz

tar -zxf curl-7.61.0.tar.gz

cd curl-7.6.10

./configure --prefix=~/library

make && make install

모든 dependency가 설치되었으면 R의 configure를 해보도록 하자.

./configure --prefix=/PATH/TO/INSTALL/R --enable-R-shlib LDFLAGS="-L~/library/lib/" CPPFLAGS="-I~/library/include/"

make && make install

중간에 warning이 뜨긴 했지만 일단 무시하고 진행했으며 R일 실행되는 것 까지 확인하였다.

Reference -

https://unix.stackexchange.com/questions/343452/how-to-install-r-3-3-1-in-my-own-directory