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파이썬에서 동적 속성과 프로퍼티(dynamic attributes and properties)는 객체 지향 프로그래밍에서 중요한 개념으로, 객체의 속성을 더 유연하고 강력하게 관리할 수 있도록 도와줍니다. 이 두 가지 개념을 이해하면, 더 효율적이고 유지보수하기 쉬운 코드를 작성할 수 있습니다. 아래에 각각의 개념을 자세히 설명하겠습니다.

1. 동적 속성 (Dynamic Attributes)

파이썬에서는 객체에 동적으로 속성을 추가하거나 제거할 수 있습니다. 이것은 파이썬의 유연한 클래스 구조 덕분에 가능한데, 다른 많은 프로그래밍 언어에서는 클래스에 정의된 속성만을 사용할 수 있는 경우가 많습니다.

 

동적 속성의 사용 사례

동적 속성은 객체의 속성을 런타임에 결정해야 하거나, 객체가 다루는 데이터 구조가 매우 유동적일 때 유용합니다. 예를 들어, JSON 응답에서 키를 동적으로 객체 속성으로 변환할 때 사용할 수 있습니다.

 

2. 프로퍼티 (Properties)

프로퍼티는 파이썬에서 제공하는 특수한 속성으로, 속성에 접근할 때 특정한 동작을 수행할 수 있게 해줍니다. 예를 들어, 속성의 값을 가져오거나 설정할 때 추가적인 로직을 수행할 수 있습니다.

 

프로퍼티의 사용 사례

프로퍼티는 다음과 같은 경우에 유용합니다:

  • 속성의 값을 가져오거나 설정할 때 검증 로직을 추가해야 할 때
  • 속성 값을 계산한 후 반환해야 할 때 (지연된 계산)
  • 속성 접근 방식을 일관되게 유지하면서 내부 구현을 변경하고 싶을 때

 

데이터 랭글링과 동적 속성의 관계

데이터 랭글링 과정에서는 데이터의 형태가 일정하지 않거나, 데이터의 구조가 런타임에 결정될 수 있습니다. 이러한 상황에서 파이썬의 동적 속성은 매우 유용하게 사용됩니다. 예를 들어, JSON이나 XML과 같은 비정형 데이터를 객체로 변환할 때, 동적 속성을 사용하면 해당 데이터를 쉽게 다룰 수 있습니다.

 

동적 속성을 이용한 데이터 랭글링의 장점

  1. 유연성: 데이터를 구조화하는 방법이 사전에 정의되지 않았을 때, 동적 속성을 사용하면 어떤 형태의 데이터도 쉽게 객체로 변환할 수 있습니다.
  2. 유지보수성: 새로운 데이터 필드가 추가되거나 변경될 때, 코드 수정이 최소화됩니다. 동적 속성을 통해 데이터를 자동으로 객체 속성으로 변환할 수 있기 때문입니다.
  3. 가독성: 동적으로 생성된 속성을 통해 데이터에 접근하는 것이, 복잡한 딕셔너리나 리스트 구조를 탐색하는 것보다 직관적이고 읽기 쉬운 코드를 작성하는 데 도움이 됩니다.

실제 활용 예시

동적 속성을 사용한 데이터 랭글링은 특히 웹 애플리케이션, API 응답 처리, 데이터 분석에서 자주 사용됩니다. 예를 들어, API 응답 데이터를 객체로 변환하여 사용하는 경우, 새로운 데이터 필드가 응답에 추가되더라도 별도의 코드 수정 없이 그 필드를 동적으로 추가하여 처리할 수 있습니다.

요약하자면, "동적 속성을 이용한 데이터 랭글링"은 파이썬의 동적 속성을 활용하여 다양한 형태의 데이터를 유연하게 다루고, 이를 통해 데이터 변환, 정제, 조작을 더 효율적으로 수행하는 방법을 의미합니다.

 

import json

class DynamicObject:
    def __init__(self, **entries):
        self.__dict__.update(entries)

# JSON 데이터를 파싱하여 파이썬 딕셔너리로 변환
json_data = '{"name": "Alice", "age": 30, "city": "New York"}'
data = json.loads(json_data)

# 동적 속성을 사용하여 객체로 변환
obj = DynamicObject(**data)

# 동적으로 추가된 속성에 접근
print(obj.name)  # 출력: Alice
print(obj.age)   # 출력: 30
print(obj.city)  # 출력: New York

 

json 파일을 원래 상태 그대로 다루다보면, 아래와 같이 번거로운 구문이 반복된다.

feed['Schedule']['speakers'][0]['name']

 

동적 속성을 이용하여 아래와 같이 사용할 수 있다면 아주 편할 것이다.

raw_feed = load()
feed = FrozenJSON(raw_feed)
print(len(feed.Schedule.speakers))
print(sorted(feed.Schedule.keys()))
print(feed.Schedule.speakers[0].name)

 

FrozenJSON class는 위와 같은 기능을 구현하고 있다.

가장 핵심은 __getattr__() method이다. 피드가 순회되면서 내포된 데이터 구조체가 차례로 FrozenJSON 포켓으로 변환된다.

from collections import abc
from loader import load

class FrozenJSON:
    '''
    점 표기법을 이용하여 JSON 객체를 순회하는
    읽기 전용 parsed class
    '''

    def __init__(self, mapping):
        self.__data = dict(mapping)

    def __getattr__(self, name):
        if hasattr(self.__data, name):
            return getattr(self.__data, name)
        else:
            return FrozenJSON.build(self.__data[name])

    @classmethod
    def build(cls, obj):
        if isinstance(obj, abc.Mapping):
            return cls(obj)
        elif isinstance(obj, abc.MutableSequence):
            return [cls.build(item) for item in obj]
        else:
            return obj


raw_feed = load()
feed = FrozenJSON(raw_feed)
print(len(feed.Schedule.speakers))
print(sorted(feed.Schedule.keys()))
print(feed.Schedule.speakers[0].name)

 

프로퍼티의 기본 사용법

프로퍼티는 property() 함수를 사용하거나, 데코레이터 @property와 그와 관련된 데코레이터(@<property_name>.setter, @<property_name>.deleter)를 사용하여 정의할 수 있습니다.

class MyClass:
    def __init__(self, value):
        self._value = value
    
    @property
    def value(self):
        return self._value
    
    @value.setter
    def value(self, new_value):
        if new_value < 0:
            raise ValueError("Value must be non-negative")
        self._value = new_value

    @value.deleter
    def value(self):
        del self._value

# 사용 예시
obj = MyClass(10)
print(obj.value)  # 10

obj.value = 20  # 정상적으로 값이 설정됨
print(obj.value)  # 20

obj.value = -5  # ValueError 발생

 

1. 프로퍼티에서 getter를 사용하는 경우

파이썬에서는 @property 데코레이터를 사용하여 속성 접근 시 자동으로 호출되는 getter 메서드를 정의할 수 있습니다. 이 방법은 속성에 접근할 때 obj.attribute 형태로 간단하게 사용할 수 있습니다.

장점

  1. 직관적이고 간결한 문법:
  2. 캡슐화:
  3. 속성에 접근할 때 추가 로직을 쉽게 추가:
  4. 유지보수성:

단점

  1. 은밀한 동작:
  2. 디버깅 어려움:

값을 얻기 위한 메서드를 따로 작성하는 경우

이 방법에서는 get_value()와 같은 이름으로 값을 얻기 위한 메서드를 직접 정의합니다. 이는 명시적으로 값을 얻기 위한 함수 호출임을 나타냅니다.

장점

  1. 명확성:
  2. 의도 표현:
  3. 구조적 일관성:

단점

  1. 사용의 불편함:
  2. 캡슐화의 부족:

결론: 언제 어떤 것을 사용할지

  • 프로퍼티(getter) 사용:
    • 속성 접근처럼 보이지만, 내부적으로 추가 로직이 필요한 경우.
    • 코드의 가독성과 간결성을 중시할 때.
    • 객체의 속성을 외부에 노출하면서도 캡슐화를 유지하고 싶을 때.
  • 메서드 사용:
    • 접근하는 값이 계산이나 복잡한 로직에 의해 생성되는 경우.
    • 메서드 호출임을 명확히 표현하고 싶을 때.
    • 코드의 명확성과 의도 표현이 중요한 경우.

 

프로퍼티 팩토리

"프로퍼티 팩토리(Property Factory)"는 파이썬에서 프로퍼티를 동적으로 생성하거나, 다수의 프로퍼티를 공통된 패턴에 따라 쉽게 정의하기 위해 사용하는 방법입니다. 즉, 객체의 속성을 정의할 때, 비슷한 패턴이나 규칙에 따라 다수의 속성을 자동으로 생성하고자 할 때 유용합니다.

 

def make_property(attr_name):
    def getter(self):
        return getattr(self, f"_{attr_name}")

    def setter(self, value):
        if value < 0:
            raise ValueError(f"{attr_name} cannot be negative")
        setattr(self, f"_{attr_name}", value)

    return property(getter, setter)

class MyClass:
    name = make_property('name')
    age = make_property('age')

    def __init__(self, name, age):
        self._name = name
        self._age = age

# 사용 예시
obj = MyClass("Alice", 30)
print(obj.age)  # 출력: 30

# 음수 값을 설정하려고 하면 ValueError 발생
try:
    obj.age = -5
except ValueError as e:
    print(e)  # 출력: age cannot be negative

 

 

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Python의 추상 클래스와 MutableMapping을 활용한 데이터 구조 설계

Python은 객체 지향 프로그래밍(OOP) 언어로서, 추상 클래스를 통해 명확한 인터페이스를 정의하고 이를 기반으로 다양한 데이터 구조를 설계할 수 있는 기능을 제공합니다. 특히, Python의 collections.abc 모듈에서 제공하는 MutableMapping 추상 클래스를 활용하면, 딕셔너리와 같은 유연한 데이터 구조를 커스터마이즈하고 확장할 수 있습니다.

이 글에서는 Python의 추상 클래스 개념과 MutableMapping을 활용한 데이터 구조 설계 방법을 설명하고, 실질적인 예제를 통해 그 활용 방법을 소개합니다.

추상 클래스 (Abstract Class)

추상 클래스는 하나 이상의 추상 메서드를 포함하는 클래스입니다. 추상 메서드는 선언만 되어 있고, 실제 구현은 제공하지 않습니다. 추상 클래스는 객체를 직접 생성할 수 없으며, 반드시 상속받아 추상 메서드를 구현해야 합니다. 이를 통해 일관된 인터페이스를 강제할 수 있습니다.

추상 클래스의 정의

from abc import ABC, abstractmethod

class AbstractDataStructure(ABC):
    @abstractmethod
    def add(self, item):
        pass

    @abstractmethod
    def remove(self, item):
        pass

    @abstractmethod
    def find(self, item):
        pass

 

위 예제에서 AbstractDataStructure는 추상 클래스이며, add, remove, find 메서드는 추상 메서드로 정의되어 있습니다. 이 클래스는 상속받아 구체적인 구현을 제공해야 합니다.

MutableMapping 추상 클래스

collections.abc 모듈의 MutableMapping 추상 클래스는 딕셔너리와 같은 매핑 타입을 정의하는 데 사용됩니다. MutableMapping은 Mapping을 상속받아 변경 가능한 매핑 타입의 인터페이스를 정의합니다.

MutableMapping을 활용한 사용자 정의 클래스

MutableMapping을 상속받아 커스터마이즈된 딕셔너리 클래스를 구현할 수 있습니다. 이를 통해 기본 딕셔너리 기능을 확장하거나 새로운 기능을 추가할 수 있습니다.

from collections.abc import MutableMapping

class CustomDict(MutableMapping):
    def __init__(self):
        self._store = {}

    def __getitem__(self, key):
        return self._store[key]

    def __setitem__(self, key, value):
        self._store[key] = value

    def __delitem__(self, key):
        del self._store[key]

    def __iter__(self):
        return iter(self._store)

    def __len__(self):
        return len(self._store)

# CustomDict 사용 예제
custom_dict = CustomDict()
custom_dict['a'] = 1
custom_dict['b'] = 2

print(custom_dict['a'])  # 출력: 1
print(custom_dict)  # 출력: {'a': 1, 'b': 2}

del custom_dict['a']
print(custom_dict)  # 출력: {'b': 2}
print(len(custom_dict))  # 출력: 1

 

CustomDict에 예제 메서드 추가 및 활용

CustomDict 클래스에 예제 메서드를 추가하여 실제로 어떻게 활용할 수 있는지 살펴보겠습니다. 이 예제에서는 increment라는 메서드를 추가하여, 특정 키의 값을 증가시키는 기능을 구현해보겠습니다.

CustomDict 클래스 정의 및 예제 메서드 추가

 

from collections.abc import MutableMapping

class CustomDict(MutableMapping):
    def __init__(self):
        self._store = {}

    def __getitem__(self, key):
        return self._store[key]

    def __setitem__(self, key, value):
        self._store[key] = value

    def __delitem__(self, key):
        del self._store[key]

    def __iter__(self):
        return iter(self._store)

    def __len__(self):
        return len(self._store)

    # 예제 메서드 추가: 특정 키의 값을 증가시키는 메서드
    def increment(self, key, amount=1):
        if key in self._store:
            self._store[key] += amount
        else:
            self._store[key] = amount

# CustomDict 사용 예제
custom_dict = CustomDict()
custom_dict['a'] = 1
custom_dict.increment('a')
custom_dict.increment('b', 5)

print(custom_dict['a'])  # 출력: 2
print(custom_dict['b'])  # 출력: 5
print(custom_dict)  # 출력: {'a': 2, 'b': 5}

 

위 예제에서 CustomDict 클래스에 increment 메서드를 추가하여, 특정 키의 값을 증가시키는 기능을 구현했습니다.

Dictionary에서 비슷하게 구현

기본 dict를 사용하여 비슷한 기능을 구현할 수도 있습니다. 이를 위해 별도의 함수를 정의해보겠습니다.

# 기본 dict를 사용하여 increment 기능을 제공하는 함수
def increment(d, key, amount=1):
    if key in d:
        d[key] += amount
    else:
        d[key] = amount

# dict 사용 예제
basic_dict = {'a': 1}
increment(basic_dict, 'a')
increment(basic_dict, 'b', 5)

print(basic_dict['a'])  # 출력: 2
print(basic_dict['b'])  # 출력: 5
print(basic_dict)  # 출력: {'a': 2, 'b': 5}

CustomDict와 기본 dict를 사용한 구현의 장단점

CustomDict의 장점

  1. 메서드 추가 및 확장 용이:
    • 클래스 메서드로 기능을 구현하면, 객체 지향적인 접근이 가능하고, 상태를 쉽게 관리할 수 있습니다.
    • 메서드를 통해 기능을 캡슐화하여 코드의 재사용성과 유지보수성을 높일 수 있습니다.
  2. 인터페이스 일관성:
    • MutableMapping을 상속받아 딕셔너리와 동일한 인터페이스를 제공하므로, 기존의 딕셔너리 사용 패턴과 호환됩니다.
  3. 추가 기능 구현의 용이성:
    • CustomDict 클래스를 확장하여 새로운 기능을 쉽게 추가할 수 있습니다.

CustomDict의 단점

  1. 복잡성 증가:
    • 기본 dict를 사용하는 것보다 클래스를 정의하고 관리하는 데 더 많은 코드와 복잡성이 필요합니다.
  2. 성능 저하 가능성:
    • 추가된 추상화 계층으로 인해 성능이 약간 저하될 수 있습니다.

기본 dict의 장점

  1. 단순성:
    • 별도의 클래스를 정의하지 않고, 단순한 함수로 기능을 구현할 수 있어 코드가 간결합니다.
    • 기본 dict는 Python의 내장 자료형이므로 추가적인 학습이나 설정 없이 바로 사용할 수 있습니다.
  2. 성능:
    • Python의 기본 dict는 C로 구현되어 있어 매우 빠릅니다.

기본 dict의 단점

  1. 재사용성 및 유지보수성 저하:
    • 기능을 함수로 구현하면, 상태와 기능이 분리되어 있어 재사용성과 유지보수성이 낮아질 수 있습니다.
    • 여러 함수로 기능을 확장하는 경우, 코드의 일관성을 유지하기 어렵습니다.
  2. 객체 지향 프로그래밍의 한계:
    • 객체 지향 프로그래밍의 이점을 활용하지 못하므로, 복잡한 상태 관리나 기능 확장이 어렵습니다.

결론

  • CustomDict: 객체 지향적인 접근으로, 상태와 기능을 캡슐화하여 코드의 재사용성과 유지보수성을 높일 수 있습니다. 복잡한 기능을 확장하는 데 유리하지만, 기본 dict보다 구현과 관리가 더 복잡합니다.
  • 기본 dict: 간단하고 성능이 우수하지만, 복잡한 기능을 확장하거나 유지보수할 때 어려움이 있을 수 있습니다.

두 접근 방식 모두 장단점이 있으므로, 특정 상황과 요구 사항에 따라 적절한 방법을 선택하는 것이 중요합니다.

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프로토콜 (Protocol)

프로토콜은 특정 메소드나 속성을 구현해야 하는 비공식적인 인터페이스입니다. Python은 강력한 덕 타이핑(duck typing) 덕분에 공식적으로 인터페이스를 정의하지 않아도 됩니다. 객체가 특정 메소드나 속성을 가지고 있다면, 그 객체는 해당 프로토콜을 구현한다고 간주합니다.

예를 들어, Python의 시퀀스 프로토콜은 __len__과 __getitem__ 메소드를 요구합니다. 리스트, 튜플, 문자열 등은 모두 이 프로토콜을 구현합니다.

 

 

인터페이스를 정의한다는 것은 클래스가 가져야 할 메소드와 속성을 명시하는 것을 의미합니다. 이는 객체 지향 프로그래밍에서 매우 중요한 개념입니다. 인터페이스는 클래스가 특정한 기능을 제공할 것이라는 계약(Contract)을 정의하며, 이를 통해 코드의 일관성을 유지하고 재사용성을 높일 수 있습니다.

인터페이스의 개념

인터페이스는 일반적으로 다음을 포함합니다:

  • 메소드 서명(Signature): 메소드의 이름, 매개변수, 반환 타입 등을 명시합니다.
  • 속성(Property): 클래스가 가져야 할 속성을 정의합니다.

인터페이스는 구현을 포함하지 않으며, 인터페이스를 상속받는 클래스는 해당 인터페이스에서 정의된 모든 메소드와 속성을 구현해야 합니다.

 

class CustomSequence:
    def __len__(self):
        return 10
    
    def __getitem__(self, index):
        return index * 2

seq = CustomSequence()
print(len(seq))        # 10
print(seq[3])          # 6

 

abc 모듈 (추상 기반 클래스)

Python의 abc 모듈은 추상 기반 클래스를 정의하는 기능을 제공합니다. 추상 클래스는 하나 이상의 추상 메소드를 포함할 수 있으며, 이러한 메소드는 서브클래스에서 반드시 구현해야 합니다. 이를 통해 공통 인터페이스를 정의하고 구현 강제를 할 수 있습니다.

추상 클래스 정의

추상 클래스는 ABC 클래스를 상속받고, 추상 메소드는 @abstractmethod 데코레이터를 사용하여 정의합니다.

 

from abc import ABC, abstractmethod

class Animal(ABC):
    @abstractmethod
    def sound(self):
        pass

class Dog(Animal):
    def sound(self):
        return "Bark"

 

추상 클래스의 역할

  1. 공통 인터페이스 정의: 추상 클래스는 여러 구체적인 클래스가 반드시 구현해야 하는 메소드와 속성을 정의합니다. 이를 통해 모든 서브클래스가 동일한 인터페이스를 가지게 됩니다.
  2. 코드 재사용성 증가: 추상 클래스는 공통 기능을 한 곳에 모아서 구현할 수 있습니다. 이를 상속받는 구체적인 클래스들은 이러한 공통 기능을 재사용할 수 있습니다.
  3. 유지보수성 향상: 코드를 수정할 때, 공통 기능은 추상 클래스에서 한 번만 수정하면 되므로 유지보수성이 높아집니다.
  4. 다형성 지원: 동일한 인터페이스를 통해 다양한 클래스와 상호작용할 수 있게 하여 다형성을 지원합니다.

 

from abc import ABC, abstractmethod

class Animal(ABC):
    def __init__(self, name):
        self.name = name

    @abstractmethod
    def sound(self):
        return "Some generic animal sound"

    @abstractmethod
    def move(self):
        return "Some generic animal movement"

    def display_info(self):
        print(f"{self.name} says {self.sound()} and {self.move()}")

class Dog(Animal):
    def sound(self):
        return "Bark"

    def move(self):
        return "Runs"

class Cat(Animal):
    def sound(self):
        return "Meow"

    # move 메소드를 재정의하지 않음

class Fish(Animal):
    # sound 메소드를 재정의하지 않음

    def move(self):
        return "Swims"

# 동물원 관리 시스템
class Zoo:
    def __init__(self):
        self.animals = []

    def add_animal(self, animal: Animal):
        self.animals.append(animal)

    def show_all_animals(self):
        for animal in self.animals:
            animal.display_info()

# 동물원에 동물 추가
zoo = Zoo()
zoo.add_animal(Dog("Buddy"))
zoo.add_animal(Cat("Whiskers"))
zoo.add_animal(Fish("Nemo"))

# 모든 동물 정보 표시
zoo.show_all_animals()

 

실행 결과

Buddy says Bark and Runs
Whiskers says Meow and Some generic animal movement
Nemo says Some generic animal sound and Swims

 

예제에서는 추상클래스 "Animal"을 선언하고 각각 Dog, Cat 그리고 Fish 클래스가 이를 상속하도록 했습니다.

 

구체적인 클래스 Zoo 에서 Dog, Cat 그리고 Fish 오브젝트를 생성하였으며 여기서 모든 동물들에게 상속받은 추상 클래스 display_info를 호출하면 실행 결과를 출력하게 됩니다.

 

 

추상클래스는 다중 상속도 가능합니다.

from abc import ABC, abstractmethod

class Printable(ABC):
    @abstractmethod
    def print(self):
        pass

class Scannable(ABC):
    @abstractmethod
    def scan(self):
        pass

class MultifunctionPrinter(Printable, Scannable):
    def print(self):
        return "Printing document"

    def scan(self):
        return "Scanning document"

# MultifunctionPrinter 클래스는 Printable과 Scannable의 추상 메소드를 모두 구현해야 합니다
mfp = MultifunctionPrinter()
print(mfp.print())  # "Printing document"
print(mfp.scan())   # "Scanning document"

 

MultifunctionPrinter에 Printable와 Scannable 추상 클래스를 다중 상속 하고 있습니다.

 

일반 메서드의 경우, 서브클래스에서 재정의하지 않으면 상속된 메서드를 그대로 사용할 수 있습니다. 즉, 서브클래스는 필요에 따라 메서드를 재정의할 수도 있고, 그렇지 않으면 상위 클래스에서 정의된 메서드를 사용할 수 있습니다.

 

그러나 추상 클래스에서 정의된 추상 메서드는 특별한 경우입니다. 추상 메서드는 기본적으로 구현되지 않은 메서드입니다. 따라서 추상 클래스에서 추상 메서드를 정의하면, 이를 상속받는 클래스는 반드시 그 추상 메서드를 재정의하여 구현해야 합니다. 그렇지 않으면 해당 서브클래스는 추상 클래스로 간주되어 인스턴스화할 수 없습니다.

 

from abc import ABC, abstractmethod

class AbstractClass(ABC):
    @abstractmethod
    def abstract_method(self):
        pass

    def concrete_method(self):
        print("This is a concrete method from the abstract class.")

class ConcreteClass(AbstractClass):
    def abstract_method(self):
        print("This is the implementation of the abstract method.")

# 인스턴스 생성
instance = ConcreteClass()
instance.abstract_method()  # This is the implementation of the abstract method.
instance.concrete_method()  # This is a concrete method from the abstract class.

 

추상 클래스의 목적은 인터페이스를 정의하고, 특정 메서드를 서브클래스에서 반드시 구현하도록 강제하는 것입니다. 이를 통해 코드의 일관성을 유지하고, 서브클래스가 필요한 기능을 올바르게 구현하도록 보장합니다.

 

 

 

직접 ABC를 정의할 수 있지만 가능하면 collections.abc나 파이썬 표준 라이브러리의 모듈에서 상속해서 써라!

 

 

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string의 format 함수로 글자 길이 고정하기.

 

print('{:<5s} [{:20s}] {:^30s} {:>5s}'.format('#####', time.ctime(), cnt_step,'#####'))

 

들여쓰기 하고 싶은 방향에 따라 <, ^, >를 넣어주면 된다.

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python multi-level argparse

 

 

parser = argparse.ArgumentParser()

subparser = parser.add_subparsers(help='Desired action to perform', dest='action')

parent_parser = argparse.ArgumentParser(add_help=False)

parser_ReDemulti = subparser.add_parser("ReDemulti", parents=[parent_parser], help='Re Demultiplexing')
parser_ReDemulti.add_argument("RunID", help='Only require one run ID which have Samplesheet_gpcd.csv')

parser_MultiAnal = subparser.add_parser("MultiAnal", parents=[parent_parser], help='Multiple Analysis from One Customer')
parser_MultiAnal.add_argument("SampleFile", help='A file with one sample ID per line')

parser_NoData = subparser.add_parser("NoDataSamples", parents=[parent_parser], help='Re Run No-Data Samples')
parser_NoData.add_argument("SampleFile", help='A file with one sample ID per line')

parser_RunFastQC = subparser.add_parser("RunFastQC", parents=[parent_parser], help='Run from FastQC Step')
parser_RunFastQC.add_argument("SampleID", help='Only require one sample ID')

parser_RmDenovo = subparser.add_parser("RmDenovoFiles", parents=[parent_parser], help='Remove Database Files in denovo01')
parser_RmDenovo.add_argument("SampleID", help='Only require one sample ID')

args = parser.parse_args()
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python 파일 입출력

 

 

python에서 파일을 찾고, 파일이 없을시 except 출력, 있다면 파일을 열어서 본문을 수행하고 파일 닫고 종료.

 

        try : 
                list_file = open(list_file_name) 

        except OSError : 
                print('can\'t find '+list_file_name) 

        else : 
                with listfile : 
                        for line in listfile :
                        	# do somthing

 

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Python 설치 및 실행하기




Python은 프로그래밍 언어의 일종으로 배우기 쉽기 때문에 입문용으로 많이 사용된다.


Data science 분야에서 전반적으로 사용하고 있다. 


다운로드 경로 https://www.python.org/downloads/ 에서 원하는 버전을 다운로드 받는다.


tar -zxf Python-*.tgz

cd Python-3.5.1

./configure --prefix=/PATH/TO/INSTALL/PYTHON

make && make install



Python 2.X 버전은 python 모듈을 쉽게 설치할 수 있는 easy_install이나 pip를 기본적으로 제공하고 있지 않다.


setuptools를 다운로드 받아서 설치해 줘야 한다.



setuptools를 다운 받았으면 설치한 python을 사용하여 아래와 같이 입력 한다.


python setup.py install


그러면 python/bin 폴더에 easy_install이 생긴다.


pip를 설치하기 위해서는 다시 한 번 아래처럼 입력 한다.


easy_install pip


bin 폴더에 pip도 생겼다.



pip를 사용하여 모듈을 설치할 때 pip install <MODULE> 를 입력하면 된다.


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